全トランスクリプトーム空間的探索により腫瘍微小環境全体の免疫細胞タイプが明らかに
固形腫瘍の中心部と周辺部における腫瘍と免疫の相互作用は、効果的な免疫応答、あるいは腫瘍進行における重要な因子です。
この新しいbioRxivプレプリントでは、ヒトFFPE大腸癌組織において、これらの免疫細胞タイプと相互作用を解明するために、Visium HDを使用したシングルセルレベルの全トランスクリプトーム空間解析の威力を紹介しています。今すぐご覧ください。
- 正常隣接組織におけるVisium HDとVisium v2のベンチマークデータと、FFPE腫瘍切片の包括的な細胞マップ
- 腫瘍周辺部に沿ってマクロファージサブタイプを局在させた、高解像度全トランスクリプトームデータでのみ可能な独自の距離ベース解析法
- Visium HD、Chromium シングルセル免疫プロファイル、Xenium In Situから得られた相補的な知見により、細胞リクルートに関与する可能性のある免疫ニッチにおいて細胞傷害性T細胞クローン型の拡大を同定
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